Der er udfordringer i alle EU’s medlemsstater, men deres præcise art og omfang varierer fra land til land. Udfordringerne kan f.eks. være ufordelagtige ændringer i lovgivningen eller utilstrækkelig gennemførelse af lovgivningen, hindringer for adgang til økonomiske ressourcer og sikring af organisationernes bæredygtighed, vanskeligheder med at få adgang til beslutningstagere og bidrage til lovgivning og beslutningstagning samt angreb på og chikane af menneskerettighedsforkæmpere, herunder en negativ fremstilling af dem, der sigter mod at stigmatisere civilsamfundsorganisationerne og svække deres legitimitet.
Den fuldstændige rapport fra Agenturet for Grundlæggende Rettigheder om denne problemstilling ser nærmere på de forskellige typer og mønstre af udfordringer, som civilsamfundsorganisationerne i EU står over for, og fremhæver lovende praksis, som kan modvirke disse bekymrende mønstre.