Предизвикателства съществуват във всички държави — членки на ЕС, но техният характер и мащаб в отделните държави се различават. Тези предизвикателства включват: неблагоприятни законодателни изменения или неправилно прилагане на законодателството, проблеми, затрудняващи достъпа до финансови ресурси и осигуряването на тяхната устойчивост, трудности във връзка с достъпа до органите, вземащи решения, и участието в процесите на определяне на законодателството и политиките, както и нападения и тормоз на защитниците на правата на човека, включително представяне в отрицателна светлина с цел делегитимиране и заклеймяване на ОГО.
В пълния доклад на Агенцията за основните права по този въпрос са разгледани различните видове и категории предизвикателства, пред които са изправени организациите на гражданското общество в ЕС, и са представени обещаващи практики, които могат да се използват за противодействие на тези пораждащи загриженост процеси.