FRA samarbetar kontinuerligt med EU:s institutioner och medlemsstater för att kunna ge dem oberoende expertråd och analyser av grundläggande rättigheter. Byrån har inrättat nätverk och etablerat förbindelser med partner på alla nivåer så att råd och forskning kan nå beslutsfattare inom nationella regeringar och EU.
Inom den här ramen har FRA särskilt nära förbindelser med:
EU:s institutioner och andra organ
Europeiska unionens medlemsstater
Europarådet
Civilsamhället och plattformen för grundläggande rättigheter
Nationella människorättsorganisationer, jämställdhetsorgan och ombudsmannainstitutioner.
FN, OSSE och övriga internationella organisationer